أنشئت وحدة المرأة والتنمية في العام 1978 بدعم من الحكومة الهولندية وصندوق الأمم المتحدة للطفولة، تعمل الوحدة في مجال القضايا التنموية الخاصة بالمرأة والنوع من خلال إجراء الدراسات والبحوث وتطوير المناهج إضافة إلى البرامج التدريبية وورش العمل والسمنارات. تقوم الوحدة بإجراء الدراسات والاستشارات حول قضايا المرأة،النوع والتنمية لمختلف المؤسسات الوطنية والدولية ومنظمات الأمم المتحدة والتي من خلالها تهدف إلى التأثير على السياسات العامة والبرامج الهادفة إلى تنمية وتطوير المرأة.

فى مجال التوثيق، للوحدة مكتبة متخصصة في مجال المرأة، النوع والتنمية تتبع إداريا لمكتبة المعهد و خدماتها متاحة لكل الباحثين والدارسين في السودان.

للوحدة حالياً مجموعة من الشراكات مع مؤسسات عالمية كصندوق الأمم المتحدة لدعم المرأة، منظمة فريدريش ليبرت الألمانية، المركز الثقافي البريطاني، الاتحاد الاوربى وآخرون.